在Node.js的Express框架中，可以通过多种方式实现身份认证。其中，常用的身份认证机制包括Session认证和JWT认证。

Session认证是一种传统的身份认证机制，适用于传统的Web开发模式。在这种模式下，服务器端负责生成HTML页面，并将页面发送到客户端进行渲染。当客户端发送请求时，服务器端会验证请求中是否包含有效的Session信息。如果Session信息有效，则根据请求的内容进行相应的处理；否则，返回错误信息或要求用户重新登录。Session认证的优点在于简单易用，适用于小型应用程序。然而，它也存在一些缺点，如服务器端资源占用较多，不利于前后端分离的开发模式。

相比之下，JWT认证是一种更加灵活的身份认证机制，适用于基于前后端分离的开发模式。在JWT认证中，客户端将用户的身份信息加密后生成Token字符串，并将Token字符串保存在客户端（如Local Storage或Session Storage）。当客户端发送请求时，会将Token字符串发送到服务器端进行验证。服务器端通过解密和验证Token字符串中的用户信息来判断请求的合法性。JWT认证的优点在于可以实现无状态管理，方便扩展，同时Token字符串可以包含用户信息，可以实现基于角色的访问控制等高级功能。然而，JWT认证也存在一些安全隐患，如Token字符串可能会被截获或篡改，需要使用HttpOnly选项来避免XSS攻击等。

在实际应用中，可以根据应用程序的需求和场景选择合适的身份认证机制。例如，对于传统的Web应用程序可以使用Session认证；对于基于微服务架构的应用程序可以使用JWT认证来实现无状态管理和灵活的角色访问控制等功能。